陆地上的哺乳动物、爬行动物，除了蛇，几乎很少有不长腿的，腿无疑是一种最高效的行动器官，它可以用用来行走、攀爬、跳跃，以应对在地形环境复杂的陆地，而蛇为什么要放弃这种高效的方式，而选择匍匐爬行的方式，实在有些令人费解。
锦蛇
想要了解蛇的这一进化动机，我们需要先了解其祖先。
蛇的祖先普遍被认为是一种史前蜥蜴，英国朴茨茅斯大学古生物学家于2012年，在德国索尔恩霍芬博物馆的私人收藏展上，偶然发现了一种史前蛇类Tetrapodophis的化石。
Tetrapodophis化石
这条蛇大约生活在9000万年-1.5亿年，科学家将Tetrapodophis定义为蛇类，因为它身体较长，拥有类似蛇的牙齿和一排腹鳞的暗示。其它特征则类似蜥蜴。它的前腿只有1厘米长，手只有5毫米，而更长的后腿可能是用于抓住猎物。
Tetrapodophis后腿骨骼
这被认为是蛇类由“蜥蜴”进化而来的证据之一，当然这里的蜥蜴并非现代意义的蜥蜴，它是在蜥蜴和蛇类共同的祖先，一种有鳞目的史前动物。
现在科学普遍认为，蛇的祖先是一种四足短小的有鳞目动物，它的外表和石龙子有些类似，我们可以从蟒蛇身上残留有骨盆带和后肢的踪迹，来确认这一点。
蟒蛇残留的骨盆带和后肢
现代蛇类的祖先确实是一种有四肢的动物，现代蜥蜴和蛇是其属下的分支，两者有很强的亲缘关系，因此，我们可以参考一些无脚类的蜥蜴来推测蛇类的进化奥秘。
石龙子
在亚洲，生活着一种无脚类的蜥蜴，叫蛇蜥，它的身体结构明显区别于蛇类，它头部更为宽大、眼睛可以眨动、耳朵形状也不同于蛇，身体结构有2/3都是尾巴。它的四肢已经完全退化，和蛇类一样靠肌肉的收缩扩张爬行。
脆蛇蜥
它们栖息于树林茂密的丘陵地带，能在在密林之中穿行，捕食昆虫、蜘蛛、蚯蚓、蜗牛，无脚蜥蜴在丛林中行动，它们擅于在泥土之中寻找食物，而无脚化也更利于它们在洞穴中觅食，同样半只脚踏入无脚蜥蜴的石龙子在很多情况下，也会放弃用腿走路。
无脚蜥蜴的存在过程，是否能够侧面论证现代蛇类的进化原因：史前蜥蜴朝着无脚化发展，是一种适应环境的表现。
一部分人相信，蛇的祖先生活在陆地，无腿的身体有助于在泥土、洞穴、水中捕食，也有着更高的行动效率。
帝王蛇蜥
还有一些人认为，蛇本来是一种生活在海洋里的动物，为了适应海洋的生态环境，在水生时代就已经进化掉了双腿，而后来移居陆地后，依然保留了无腿这一特性。
两种说法都指向同一个答案，蛇本来是有腿的，进化到没有双腿是基于环境的选择。
海蛇
一切似乎都合情合理，完美符合进化论，但是，今天大量蜥蜴的存在证明：蛇类的无脚化发展并不是必要之举。和蛇拥有共同祖先的蜥蜴，靠着四肢行动，依然活得好好的，无腿化并非这类有鳞目进化的必然方向。
那前面的推测又有些说不通了，既然不是生活所迫，蛇的祖先为什么要把自己的四肢给消灭掉呢？
针对这个问题，科学家又经过了一系列的研究，结果发现：蛇的身上依然还存在着控制四肢生长的基因，但是这部分基因在它发育过程中被抑制了。
而蛇类四肢消失的秘密，就跟这段关键的基因有关。研究人员把一段蛇类的基因接到小白鼠的基因中，结果产生的小白鼠身型正常，但四肢短小。
实验中蛇样小白鼠所含的蛇类基因包含一个DNA段落，称之为ZRS调控基因。ZRS对小白鼠的后肢形成非常重要，只要这一基因发生单一的突变，就会造成身体异常。在爬行动物中这段基因尤为重要，在进化过程中通常都会维持不变，但在蛇类身上却发生了高度的变异。
蟒蛇未完全退化的后肢
由此我们可以大胆猜测：蛇的诞生可能只是一个意外。
在千万年前，某只史前蜥蜴发生了基因突变，其中表达四肢生长的基因出了问题，它的腿没能顺利长出来，但是它却靠着匍匐滑动奇迹般的活了下来，而这种病态的基因表达得到了延续。
蛇类的诞生过程，几乎可以解释90%的“生物为什么这样进化”这样的问题，生物的进化并不是一个精密计划的过程，它充满了偶然性的过程，基因突变的方向是无序的没有规则的，只是某些变异生物又刚好活了下来。
